STR基因座因其在人類基因中分布廣泛、片段小、易擴增,所需檢材微量及其高度雜合性、高度多態性而廣泛應用于構建人類遺傳圖譜、基因定位、遺傳病連鎖分析、基因診斷和法醫學鑒定方而。木研究探討了湖南漢族人群12個常染色體STR基因座的遺傳多態性,為該地區漢族人群法醫學個人識別和親權鑒定提供基礎數據。
1 材料與方法
收集1200名漢族無關個體的血樣,均采自湖南省所轄各區健康志愿者。采用Chelex-100法提取基因組DNA。應用Investigator HDplex試劑盒\\(德國QIAGEN公司\\)進行復合擴增,PCR反應在9700型擴增儀\\(美國AB公司\\)上進行,PCR反應體系為10 },LPCR循環條件為:94 0C 4min;94 0C 30s, 60 0C 120s,72 0C 75s,30個循環;68 0C 60 min。采用標準品 DNA9947A美國Promega公司\\)作為陽性對照。PCR產物變性后在3130XL型遺傳分析儀\\(美國AB公司\\)上進行毛細管電泳,采用GeneMapper ID v3.2軟件分析,并對基因型頻率進行Hardy-Weinher、平衡檢驗。采用PowerStats軟件分別計算12個常染色體STR基因座的群體遺傳學參數,包括個體識別率\\(DP\\)、觀察雜合度\\(Ho\\)、期望雜合度\\(He\\)、多態信息含量\\(PIC\\)、二聯體非父排除率\\(PED\\)和三聯體非父排除率\\(PET\\)。
2 結果與討論
12個常染色體STR基因座在1200名湖南地區漢族無關個體的等位基因頻率見表1,群體遺傳學參數見表2}經對每個基因座的基因型分布進行Xz檢驗,符合Hardy-Weinberg平衡定律\\(P>0.05 \\)。在1200名湖南地區漢族無關個體中,12個常染色體STR基因座共檢出185個等位基因,625種基因型組合。12個STR基因座的DP均大于0.8,在群體中的累計個體識別能力\\(CDP\\)為0.999 999 999 88。除D2S1360基因座外,各STR基因座的He均大于0.7,這一結果與張素華等[<<}在華東漢族人群中的研究結果一致。由于各基因座之間相互獨立,采用乘法原則計算后發現,該系統在二聯體中的累積非父排除率\\(CPED\\)為0.999 78,在三聯體中的累積非父排除率\\(CPET\\)為0.999 998 2。
木研究用Investigator HDplex試劑盒熒光標記復合擴增系統,對1200名湖南地區漢族無關個體進行基因分型,獲取了12個STR基因座在湖南地區的相關群體遺傳學數據,為該地區漢族人群法醫學個人識別和親權鑒定提供基礎數據,結果表明這12個STR基因座在湖南漢族人群中具有良好的多態信息,可以作為補充的STR基因座為一些常用STR基因座仍不能解決的親權鑒定案件提供更多的遺傳信息。
參考文獻:
[1]張素華,張拮人,孫寬,等.Investigator HDplex試齊,]盒在華東漢族人群中的法醫學應用價值.法醫學雜志,2012,28\\(5\\):351-354.